Ви є тут
МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧНИЙ АНАЛІЗ СКЛАДУ МІКРОФЛОРИ ВОДИ БІОФІЛЬТРА В УСТАНОВКАХ ЗАМКНУТОГО ВОДОПОСТАЧАННЯ
Метою роботи було провести секвенування сДНК мікрофлори води біофільтра та порівняння 16S rДНК і 16S РНК клонів, наявних у бібліотечній базі. Ідентифіковано 11 бактеріальних філотипів. Встановлено, що більша частина секвенованих клонів належала до філотипу Gammaproteobacteria – 56,7 %. 12,2 % припадало на клас Alphaproteobacteria. Частка філотипу CFB становила 8,88 %, що в 6,4 разів (р < 0,05) менше, ніж Gammaproteobacteria і в 1,5 рази (р < 0,05) ніж Alphaproteobacteria. Частка решти філотипів такі як Nitrospirae, Betaproteobacteria, Planctomycetes, Deltaproteobacteria, Uncultured bacterium Verrucomicrobia, Firmicutes не перевищувала 6 %, і найменш чисельним був філо-тип Actinobacteria – 0,5 %.
Отже, молекулярно-генетичні дослідження дали змогу виявити, найбільш поширені й стабільні класи і роди бактерій, які формують активний нормомікробіоценоз у реакторі біофільтра за вирощування райдужної форелі.
Ключові слова: установки замкнутого водопостачання, райдужна форель, біофільтр, мікрофлора, секвенування.
СПИСОК ЛІТЕРАТУРИ
1. Eding E.H., and Kamstra, A. (2002), “Netherlands farms tune recirculation systems to production of varied species”, Global Aquaculture Advocate, Vol. 5, pp. 52–54.
2. Good C., Davidson J., Welsh C., Brazil B., Snekvik K. and Summerfelt, S. (2009), “The impact of water exchange rate on the health and performance of rainbow trout Oncorhynchus mykiss in water recirculation aquaculture systems”, Aquaculture, Vol. 294, pp. 80–85.
3. Hoffmann M., Brown E.W., Feng P.C.H., Keys C.E., Fischer M. and Monday, S.R. (2010), “PCR-based method for targeting 16S-23S rRNA intergenic spacer regions among Vibrio species”, BMC Microbiology, Vol. 10, P. 90.
4. Hishamunda N. and Ridler N. (2011), “Policy and governance in aquaculture: lessons learned and way forward”. FAO Fisheries and Aquaculture Technical Paper №. 555. Rome, FAO.
5. Hardy R.W., Fornshell G.C.G. and Brannon. E.L. (2000), “Rainbow trout culture”. In R.R. Stickney, (Ed), Encyclopedia of Aquaculture. John Wiley & Sons, New York, NY. 716–722.
6. Harold J., Schreier N. and Keiko, S. (2010), “Microbial diversity of biological filters in recirculating aquaculture systems”, Current Opinion in Biotechnology, Vol. 21, pp. 1–8.
7. Itoi S., Ebihara N., Washio S. and Sugita, H. (2007), “Nitrite-oxidizing bacteria, Nitrospira, distribution in the outer layer of the biofilm from filter materials of a recirculating water system for the goldfish Carassius auratus”, Aquaculture, Vol. 264, pp. 297–308.
Долучення | Розмір |
---|---|
nvvm_1_2018_grynevych_153-157.pdf | 284.25 КБ |